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基于血清药归天学与网络药理学探究麝香通心滴丸治疗冠心病的机制(三)

发表于 2024-10-17 18:14:56 来源:饕餮之徒网

3.2麝香通心滴丸入血成份网络药理学钻研

3.2.1浸染靶点预料

将麝香通心滴丸8个入血成份上传至PharmMapper数据库后患上到的基于究麝所有靶点,删除了重复并整合患上到浸染靶点249个。血清学探香通心滴心病经由与GeneCards数据库中的药归药理1 778个与冠心病相干基因妨碍立室,并经由R软件绘制韦恩图,天学筛选出134个成份-疾病交加靶点,网络丸治见表二、疗冠图10。基于究麝再经由Cytoscape 3.7.1软件将8个入血成份与134个成份-疾病交加靶点相连,血清学探香通心滴心病绘制出麝香通心滴丸的药归药理药物-靶点相互浸染的网络图,见图11。天学

表2图10

图11

3.2.2卵白相互浸染网络构建与合成

将韦恩图患上到的网络丸治134个交加基因输入String数据库中妨碍合成患上到PPI图,见图12,疗冠其中包罗134个节点,基于究麝347条边,血清学探香通心滴心病平均节点度值为5.18,药归药理PPI富集P值少于1.0×1016,其中节点呈现卵白,每一条边则呈现卵白与卵白之间的相互浸染关连,线条越多呈现分割关连度越大。将String中下载的tsv文件用R语言妨碍解决(以各卵白衔接的节点个数为指标,摆列节点数排名前30个的卵白),患上到PPI中的中间基因丝裂原活化卵白激酶1(MAPK1)、酪氨酸激酶(SRC)、磷脂酰肌醇3激酶(PIK3R1)等中间基因,见图13。

图12

图13

3.2.3靶标GO富会集成及通路富会集乐成果

运用David 6.7平台对于134个药物-疾病交加靶点妨碍GO富会集成及通路富会集成。GO富会集成包罗份子功能合成、细胞组分合成、生物学历程合成,以-lgP值妨碍排名并列出排名前15的蹊径,见图14。在份子功能层面主要波及类固醇激素受体活性、配体依附性核受体活性等方面;在细胞组分层面主要波及细胞外基质、细胞质、细胞质囊泡等方面;生物学历程层面主要波及有机物资的反映、内源性鼓舞的反映、激素鼓舞的反映、调节细胞增殖等方面。对于富集患上到的通路服从,以-lgP值及各通路衔接的基因数从大到小妨碍排名,见图15。经由查阅文献,该8个入血成份可能经由ErbB signaling pathway、VEGF signaling pathway、PPARsignaling pathway等信号通路治疗冠心病。

图14图15

3.2.4份子对于接

将上述8个入血成份与上述互作关连排名前10的中间靶点妨碍份子对于接,服从见表3,散漫能(affinity)越小则对于接服从越好,affinity<-7呈现具备较好的散漫活性,可见该8个入血成份与大少数中间靶点对于接服从根基较好。其中,去乙酰华蟾毒精与MAPK1散漫活性最高,其份子对于接细节模拟见图16,可知小份子散漫在卵白的活性口袋,而且有以及活性口袋有较好的立室。

表3图16

申明:本文所用图片、翰墨源头《中成药》2020年10月,版权归原作者所有。如波及作品内容、版权等成果,请与本网分割

相干链接:卵白磷脂酰肌醇类固醇散漫

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